以前は食事の選択権がなかったが、これは評判が必ずしもよくない。
最近では、食事は数種類のプランが用意されて、宿泊客が選択できる旅館もある。料理旅館のみならず、観光旅館や温泉旅館でも、郷土料理や地元名産の食材を用いた料理など、食事の質の高さをセールスポイントとしている旅館が多い。
食事の量が多すぎて女性や高齢者など小食の人が食べきれないという問題もあり、そのような宿泊客への配慮から、かつてに比べて食事の量が少なめになっており、また、量を少なめにしながら質を向上させているところが増えている。
なお、食事は館内の大広間や食堂で供するところもあるが、仲居が客室内まで運んで膳で供する、いわゆる「部屋食（へやしょく）」が一般的である。原則部屋食の旅館でも、多人数の団体には客室でなく宴会場などの大広間で供する場合が多い。
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サービス利用時間が自由でなく、食事の時間や入浴の時間帯が指定されることが多い。また、チェックアウト時間もどちらかというと早めに催促されることがある。業務運営上の都合とはいえ、これも評判はよくない。